MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas

Total Repeats: 24731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007799	AAC	3	9	62	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657847
2	NC_007799	TTA	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657847
3	NC_007799	ATA	2	6	194	199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
4	NC_007799	AAT	2	6	205	210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
5	NC_007799	A	6	6	217	222	100 %	0 %	0 %	0 %	88657847
6	NC_007799	A	6	6	230	235	100 %	0 %	0 %	0 %	88657847
7	NC_007799	ATA	2	6	245	250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
8	NC_007799	AGA	2	6	260	265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657847
9	NC_007799	ATCA	2	8	346	353	50 %	25 %	0 %	25 %	88657847
10	NC_007799	TCA	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657847
11	NC_007799	TAA	2	6	570	575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
12	NC_007799	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	88657847
13	NC_007799	TTTAAA	2	12	616	627	50 %	50 %	0 %	0 %	88657847
14	NC_007799	ATTA	2	8	646	653	50 %	50 %	0 %	0 %	88657847
15	NC_007799	A	6	6	677	682	100 %	0 %	0 %	0 %	88657847
16	NC_007799	A	6	6	757	762	100 %	0 %	0 %	0 %	88657847
17	NC_007799	ACA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657847
18	NC_007799	CAT	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658505
19	NC_007799	TAAAAA	2	12	1066	1077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	88658505
20	NC_007799	AGA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88658505
21	NC_007799	ATA	2	6	1152	1157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
22	NC_007799	TATCA	2	10	1160	1169	40 %	40 %	0 %	20 %	88658505
23	NC_007799	ATA	2	6	1176	1181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
24	NC_007799	T	6	6	1242	1247	0 %	100 %	0 %	0 %	88658505
25	NC_007799	ATG	3	9	1279	1287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658505
26	NC_007799	TAT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658505
27	NC_007799	GTT	2	6	1320	1325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88658505
28	NC_007799	AAT	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
29	NC_007799	A	8	8	1412	1419	100 %	0 %	0 %	0 %	88658505
30	NC_007799	AT	3	6	1444	1449	50 %	50 %	0 %	0 %	88658505
31	NC_007799	ATGTCA	2	12	1456	1467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88658505
32	NC_007799	ATA	3	9	1479	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
33	NC_007799	AACGTT	2	12	1525	1536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88658505
34	NC_007799	AAT	2	6	1581	1586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658005
35	NC_007799	TAAA	2	8	1598	1605	75 %	25 %	0 %	0 %	88658005
36	NC_007799	CGG	2	6	1683	1688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88658005
37	NC_007799	AAAAAC	2	12	1750	1761	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	88658005
38	NC_007799	ACTAT	2	10	1843	1852	40 %	40 %	0 %	20 %	88658005
39	NC_007799	TA	3	6	1924	1929	50 %	50 %	0 %	0 %	88658005
40	NC_007799	TGG	2	6	1935	1940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88658005
41	NC_007799	TAGT	2	8	1994	2001	25 %	50 %	25 %	0 %	88658005
42	NC_007799	TGA	2	6	2019	2024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658005
43	NC_007799	AC	3	6	2063	2068	50 %	0 %	0 %	50 %	88658005
44	NC_007799	CT	3	6	2110	2115	0 %	50 %	0 %	50 %	88658005
45	NC_007799	CAAT	2	8	2148	2155	50 %	25 %	0 %	25 %	88658005
46	NC_007799	AT	4	8	2210	2217	50 %	50 %	0 %	0 %	88658005
47	NC_007799	AAC	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88658630
48	NC_007799	TTG	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88658630
49	NC_007799	CAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88658630
50	NC_007799	GTAT	2	8	2363	2370	25 %	50 %	25 %	0 %	88658630
51	NC_007799	A	6	6	2377	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	88658630
52	NC_007799	TTCA	2	8	2398	2405	25 %	50 %	0 %	25 %	88658630
53	NC_007799	TAG	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658630
54	NC_007799	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658630
55	NC_007799	TAT	2	6	2519	2524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658630
56	NC_007799	A	6	6	2578	2583	100 %	0 %	0 %	0 %	88658630
57	NC_007799	TGA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658230
58	NC_007799	T	6	6	2939	2944	0 %	100 %	0 %	0 %	88658230
59	NC_007799	TA	3	6	2975	2980	50 %	50 %	0 %	0 %	88658230
60	NC_007799	TCA	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658230
61	NC_007799	GACA	2	8	3035	3042	50 %	0 %	25 %	25 %	88658230
62	NC_007799	TAA	2	6	3118	3123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658230
63	NC_007799	CTG	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88658230
64	NC_007799	T	7	7	3308	3314	0 %	100 %	0 %	0 %	88658230
65	NC_007799	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658230
66	NC_007799	TAATA	2	10	3674	3683	60 %	40 %	0 %	0 %	88657649
67	NC_007799	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	88657649
68	NC_007799	GAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
69	NC_007799	CAT	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
70	NC_007799	GAAA	2	8	3931	3938	75 %	0 %	25 %	0 %	88657649
71	NC_007799	TAT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657649
72	NC_007799	CAA	2	6	4002	4007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657649
73	NC_007799	TGA	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657649
74	NC_007799	ATA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
75	NC_007799	GAAAA	2	10	4043	4052	80 %	0 %	20 %	0 %	88657649
76	NC_007799	TAAA	2	8	4065	4072	75 %	25 %	0 %	0 %	88657649
77	NC_007799	AGA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
78	NC_007799	TTC	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88657649
79	NC_007799	ATA	2	6	4157	4162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
80	NC_007799	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657649
81	NC_007799	GGCAA	2	10	4296	4305	40 %	0 %	40 %	20 %	88657649
82	NC_007799	AAT	2	6	4310	4315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
83	NC_007799	GAA	3	9	4355	4363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
84	NC_007799	AAT	2	6	4379	4384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
85	NC_007799	A	6	6	4398	4403	100 %	0 %	0 %	0 %	88657649
86	NC_007799	GTT	2	6	4435	4440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88657649
87	NC_007799	CA	3	6	4478	4483	50 %	0 %	0 %	50 %	88657649
88	NC_007799	TAT	2	6	4504	4509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657649
89	NC_007799	TA	3	6	4517	4522	50 %	50 %	0 %	0 %	88657649
90	NC_007799	A	7	7	4525	4531	100 %	0 %	0 %	0 %	88657649
91	NC_007799	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	88657649
92	NC_007799	AGA	2	6	4645	4650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
93	NC_007799	GAT	2	6	4823	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657649
94	NC_007799	AGC	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88657649
95	NC_007799	CTA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
96	NC_007799	TA	3	6	5168	5173	50 %	50 %	0 %	0 %	88657649
97	NC_007799	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	88657649
98	NC_007799	CAT	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
99	NC_007799	CAT	2	6	5261	5266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
100	NC_007799	GAA	2	6	5366	5371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
101	NC_007799	ATA	2	6	5373	5378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
102	NC_007799	TAC	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
103	NC_007799	A	6	6	5406	5411	100 %	0 %	0 %	0 %	88657649
104	NC_007799	TAG	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657649
105	NC_007799	A	6	6	5471	5476	100 %	0 %	0 %	0 %	88657649
106	NC_007799	GAA	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
107	NC_007799	AGC	2	6	5523	5528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88657649
108	NC_007799	ATT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657649
109	NC_007799	A	6	6	5617	5622	100 %	0 %	0 %	0 %	88658160
110	NC_007799	TAA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658160
111	NC_007799	AATGA	2	10	5645	5654	60 %	20 %	20 %	0 %	88658160
112	NC_007799	A	7	7	5662	5668	100 %	0 %	0 %	0 %	88658160
113	NC_007799	TTG	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88658160
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115	NC_007799	ATG	2	6	5772	5777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658160
116	NC_007799	AAG	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88658160
117	NC_007799	A	6	6	5851	5856	100 %	0 %	0 %	0 %	88658160
118	NC_007799	A	6	6	5862	5867	100 %	0 %	0 %	0 %	88658160
119	NC_007799	CAT	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658160
120	NC_007799	TAA	2	6	6042	6047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658160
121	NC_007799	A	6	6	6085	6090	100 %	0 %	0 %	0 %	88658160
122	NC_007799	AAAAT	2	10	6124	6133	80 %	20 %	0 %	0 %	88658160
123	NC_007799	ATC	3	9	6456	6464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658287
124	NC_007799	TAA	2	6	6467	6472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658287
125	NC_007799	TTTC	2	8	6494	6501	0 %	75 %	0 %	25 %	88658287
126	NC_007799	TATT	2	8	6515	6522	25 %	75 %	0 %	0 %	88658287
127	NC_007799	TAA	2	6	6549	6554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658287
128	NC_007799	CAT	2	6	6581	6586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658287
129	NC_007799	AATT	2	8	6629	6636	50 %	50 %	0 %	0 %	88658287
130	NC_007799	AT	3	6	6654	6659	50 %	50 %	0 %	0 %	88658287
131	NC_007799	TTA	2	6	6667	6672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658287
132	NC_007799	TAA	2	6	6686	6691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658287
133	NC_007799	AGT	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658287
134	NC_007799	T	6	6	6804	6809	0 %	100 %	0 %	0 %	88658287
135	NC_007799	TTAC	2	8	6904	6911	25 %	50 %	0 %	25 %	88657820
136	NC_007799	AT	3	6	6942	6947	50 %	50 %	0 %	0 %	88657820
137	NC_007799	AGT	2	6	6967	6972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657820
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139	NC_007799	CAT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657820
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